直屬二級機構有沅江市森林病蟲害防治保護站、沅江市濕地保護站、沅江市瓊湖國家濕地公園事務中心、沅江市林木種苗和技術推廣站、沅江市林業調查事務中心、沅江市南洞庭湖風景名勝事務中心、沅江市林長制事務中心。獨立二級機構有湖南省沅江市龍虎山國有林場（沅江市龍虎山省級森林公園管理所）、沅江市苗圃場（沅江市目平湖林蘆站）、沅江市林業科學研究所。